ماموریت موسسه گفتگوی دینی وحدت، ترویج و فرهنگ سازی وحدت ميان پیروان مذاهب اسلامی و همزیستی مسالمت آمیز میان پیروان ادیان با نگاه تمدنی و از طریق گفتگوی دینی و ارتباطات فکری، فرهنگی و هنری در جغرافیای ملی و بین المللی است.
1. حرکت در پرتو دستورات قرآن و اهل بیت علیهم السلام و تعالیم ادیان الهی در زمینه گفتگوی دینی
2. حفظ هویت حوزوی موسسه
3. رعایت اخلاق و ادب انسانی و دینی درگفتگو
4. مبارزه با تفرقه دینی و مذهبی
5. داشتن تخصص علمی برای ورود به فرآیند گفتگوی دینی
6. نواندیشی و نوآوری روشی در گفتگوی دینی
موسسه گفتگوی دینی وحدت در افق 1407 هجری شمسی، مرجعیت علمی و ارتباطی گفتگوی ادیان و مذاهب در جهان اسلام و در ارتباط با ادیان دیگر را به دست آورده است و توانسته جنبشی فکری و ارتباطی در زمینه گفتگوی ادیان و مذاهب ایجاد کند.
1. مدیریت برگزاری گفتگوهای دینی محقق کننده بیانیه ماموریت
2. مدیریت بهینه منابع انسانی متخصص در عرصه ادیان و مذاهب
3. مطالعات دقیق و کاربردی ادیان و مذاهب در راستای تحقق بیانیه ماموریت
4. هدایت فرآیندهای آموزشی، پژوهشی، تبلیغی و فرهنگ سازی در حوزه و دانشگاه در راستای بیانیه ماموریت
5. شبکه سازی از فعالان ادیان و مذاهب در کشورهای مختلف
6. گفتمان سازی و جریان سازی با تمرکز بر وحدت و همزیستی مسالمت آمیز